29 сентября 2017 года Антон Алиханов официально вступил в должность губернатора Калининградской области.
Он выиграл выборы 10 сентября. Cогласно озвученным на заседании данным, в голосовании в воскресенье, 10 сентября, приняли участие 315 337 избирателей — 39,35% от числа включенных в списки. Антон Алиханов получил 255 491 голос избирателей (81,06% от числа пришедших на выборы).
До этого Алиханов почти год возглавлял регион в качестве временно исполняющего обязанности губернатора. Главой региона он стал после отставки Евгения Зиничева.