По состоянию на 1 сентября фиксируются значительные проблемы с исполнением госпрограммы развития Калининградской области по линии Росморречфлота и Росмолодежи. Кассовое исполнение составляет соответственно 2% и 8,9%. Росморречфлот реализовывает проект строительства парома для организации стабильной связи по морю с остальной территорией РФ, а Росмолодежь организует экскурсионные поездки молодежи на остальную территорию РФ. Также невысок уровень исполнения по Росавтодору, который курирует строительство дорог в рамках госпрограммы (25%). Такие данные приводятся в заключении Счетной палаты РФ на проект федерального бюджета, внесенный в Госдуму.
Также в документе указывается на высокий уровень неисполнения расходов по Федеральной целевой программе, которая является ключевой составляющей госпрограммы, в 2019 году. Он составил 27%.
Анализируя исполнение госпрограммы в 2019 году, аудиторы обращают внимание на невыполнение плановых показателей по приросту протяженности дорог, соответствующих нормативным требованиям (план — 13,13 км, факт — 3,235 км), доле дорог в ненормативном состоянии (план — 50,93%, факт — 53,4%), доле школьников учащихся в первую смену (план — 91%, факт — 86,9%), потреблению электроэнергии (план — 4 473 млн кВт в час, факт — 4 452 млн кВт в час) и младенческой смертности (план — 4,5 на 1 000 родившихся живыми, факт — 5,8 на 1 000 родившихся живыми).